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exFAT基本上将FAT文件系统提升到了一个新的高度，增加了大量FAT32系统所缺乏的功能。对于做视频编辑的人来说，其中一个关键的功能是支持>4GiB文件和比FAT32通常支持的更大的分区大小，使其更容易与现代的多字节硬盘一起工作。有一些人正在研究Linux的exFAT支持，但我不知道他们的工作进展如何，而且和以往一样，有可能会像使用NTFS一样损坏你的数据…..
来自维基百科 (我的评论是黑体):
微软的开发者们基本上是将FAT32文件系统更新为exFAT，从32位寻址到64位寻址，提供了一个比NTFS更快的速度选择，同时使创建、存储或传输巨大的文件，大于4GiB的文件成为可能。从理论上讲，exFAT没有NTFS那样的操作开销，因为它缺乏许多增加文件系统的复杂性（从而增加了处理时间和磁盘延迟）的功能。
一些缺失的功能（对于可移动媒体来说，这些功能实际上是无用的或浪费）包括：
唯一的缺点是，微软没有向公众发布exFAT，要求公司授权在他们的设备上使用。这可能更多的是针对数字录像机类型的设备，家庭用户可以获得许可在Windows中使用它。
然而，在处理能力和内存有限的系统上，exFAT应该是NTFS的真正竞争对手。NTFS在闪存上的效率低下已经有一段时间了。当然，前提是你对 “理想 "的定义允许软件是专有的而不是开源的。
如果你使用EFS “Encrypted "属性（EFS是Encrypting File System的缩写，它实际上并不是一个文件系统，而是NTFS的一个功能），有一个非常重要的区别。你是看不到的。当你将加密的文件复制到另一个NTFS卷时，它将会使用与原文件相同的密钥保持加密。基本上，如果你想把你的文件带到另一台安装了所有相同的解密证书的电脑上，选择NTFS在可移动硬盘上。这样，你的文件在传输过程中会保持加密，但在所有授权的电脑上都可以透明地访问。Neat-o!
然而，如果你通常把文件带到没有解密证书的机器上，那么当文件被复制到外部磁盘时，没有办法告诉Windows自动解密](https://superuser.com/questions/188119/how-to-remove-encrypted-flag-when-copying-a-file-from-a-hdd-to-a-usb-drive)。如果你忘记了手动解密，你将无法在另一台机器上访问它。如果你经常这样做，在可移动硬盘上**选择exFAT**。
如果你不使用EFS（几乎每个人都是这样），那么显然这并不适用。我想这是继 "与其他操作系统的兼容性 "之后的第二大区别。
NTFS有日志功能，有助于确保文件系统能够从损坏中恢复，而exFAT则没有。因此，如果你只在Windows PC上使用该硬盘，而且可靠性和数据完整性很重要，比如用于存档或备份，那么NTFS应该比exFAT。 来源 (然后是许多其他同类信息的来源)
在我们看来，exFAT只有一个真正的 “不那么积极 "的地方，那就是缺乏对日志的支持。日志是一种功能，它允许文件系统保存对存储在其上的文件的更改记录。这在数据损坏时非常有用，因为日志可以用来恢复损坏的数据，而exFAT则没有这个功能，这意味着当意外关机或者以这种方式格式化的可移动硬盘无法安全弹出时，数据更容易损坏。
Google的很多结果似乎表明，它好很多，原因有很多（它比较新，还是老生常谈的理由，比如更小，更快，更高效），但也不太兼容，只有Vista和7。 这是我找到的最好的，图说明了很多。